Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
H2al1nQ497L1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms