Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms