Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp48Q3V0C5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp48Q3V0C5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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