Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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