Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nlrc4Q3UP24 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nlrc4Q3UP24 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms