Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3j1Q3UGC7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif3j1Q3UGC7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms