Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Frmd8Q3UFK8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms