Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Parp8Q3UD82 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms