Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim7Q3TJD7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms