Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VgfQ0VGU4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VgfQ0VGU4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms