Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc39dQ0VF76 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc39dQ0VF76 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms