Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Samd12Q0VE29 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Samd12Q0VE29 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms