Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Rundc1Q0VDN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms