Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col9a2Q07643 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col9a2Q07643 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms