Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh3bp2Q06649 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sh3bp2Q06649 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sh3bp2Q06649 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh3bp2Q06649 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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