Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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