Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp1Q01514 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms