Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AlkP97793 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AlkP97793 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AlkP97793 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AlkP97793 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms