Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smarcc1P97496 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms