Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lig3P97386 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms