Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
H3f3aP84244 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms