Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Paxbp1P58501 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms