Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad23aP54726 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad23aP54726 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms