Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Apobec1P51908 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms