Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc13P50207 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc13P50207 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms