Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcd1P48410 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms