Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PtprkP35822 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprkP35822 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms