Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptpn11P35235 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms