Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rom1P32958 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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