Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch4P31695 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Notch4P31695 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms