Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprmP28828 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprmP28828 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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