Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Defa3P28310 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms