Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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