Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PparaP23204 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PparaP23204 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PparaP23204 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PparaP23204 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PparaP23204 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PparaP23204 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PparaP23204 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PparaP23204 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PparaP23204 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms