Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Eif3aP23116 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms