Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxb9P20615 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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