Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
P20040 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
P20040 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
P20040 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
P20040 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms