Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NefhP19246 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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NefhP19246 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NefhP19246 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NefhP19246 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms