Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtpraP18052 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms