Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa-rs1P17533 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa-rs1P17533 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa-rs1P17533 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Defa-rs1P17533 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Defa-rs1P17533 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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