Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FosbP13346 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FosbP13346 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FosbP13346 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms