Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrm1P12657 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms