Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lire1P11260 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lire1P11260 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms