Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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