Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Me1P06801 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Me1P06801 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Me1P06801 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Me1P06801 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Me1P06801 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Me1P06801 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms