Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tp53P02340 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms