Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Foxq1O70220 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Foxq1O70220 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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