Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copb2O55029 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copb2O55029 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copb2O55029 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms