Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb3O54890 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb3O54890 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb3O54890 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms