Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MttpO08601 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MttpO08601 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MttpO08601 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MttpO08601 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MttpO08601 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms